محققان باکتری ها و ویروس های جدیدی را روی پوست انسان شناسایی کرده اند
محققان مؤسسه بیوانفورماتیک اروپایی (EMBL-EBI)، مؤسسه ملی بهداشت (NIH)، مؤسسه ملی تحقیقات ژنوم انسانی (NHGRI)، مؤسسه ملی آرتریت و بیماری‌های اسکلتی و عضلانی و پوست و همکاران، باکتری‌های جدیدی را شناسایی کرده‌اند. گونه های قارچی و همچنین ویروس های موجود در میکروبیوم پوست انسان.
میکروبیوم ها - اجتماعات میکروارگانیسم ها - در همه جا یافت می شوند، از اقیانوس ها و خاک گرفته تا روده های انسان و سطح پوست. تصور می شود که میکروبیوم پوست نقش کلیدی در سلامت و بیماری پوست دارد. برخی از میکروارگانیسم های موجود در میکروبیوم پوست با بیماری های پوستی مختلفی از جمله آکنه و اگزما مرتبط هستند.
در این مطالعه منتشر شده در میکروبیولوژی طبیعیمحققان ژنوم میکروارگانیسم های موجود در 594 نمونه گرفته شده از سطوح مختلف پوست 12 داوطلب سالم را توالی یابی کردند. با ترکیب کشت سنتی آزمایشگاهی با رویکرد توالی یابی متاژنومی، محققان توانستند مجموعه ای از ژنوم پوست میکروبی (SMGC) ایجاد کنند - مجموعه ای از ژنوم های مرجع برای میکروبیوم پوست انسان.
تنوع در میکروبیوم پوست ما
سارا کشاف، Ph.D. گفت: «ما هزاران توالی ویروسی، از جمله بسیاری از فاژهای جامبو - ویروس‌های بسیار بزرگی که باکتری‌ها را آلوده می‌کنند - پیدا کردیم، اغلب روی دست‌ها و پاهای داوطلبانمان. دانشجو در NIH و EMBL-EBI. "این نواحی از بدن دارای طیف گسترده ای از میکروبیوم ها هستند، که منطقی است زیرا ما دائما از دستان خود برای لمس چیزهای جدید در محیط خود استفاده می کنیم. کار آینده ما این خواهد بود که بفهمیم این میکروب های مختلف در این جوامع چه می کنند."
محققان از روش‌های گسترده‌ای از کشت آزمایشگاهی، توالی‌یابی متاژنومی و متاژنوماهای پوستی در دسترس عموم برای به دست آوردن این بینش جدید در مورد درجه تنوع در میکروبیوم پوست استفاده کرده‌اند. این مطالعه عمدتاً بر روی افراد از آمریکای شمالی متمرکز است، اما هدف کار آینده گسترش SMGC با استفاده از نمونه‌هایی از جمعیت‌های مختلف است.
جولی سگر، محقق ارشد NHGRI می گوید: «این کار گام بزرگی در جهت دستیابی به ژنوم کامل میکروبیوم پوست است. "ما امیدواریم که این داده ها از تحقیقات آینده که درک ما از سلامت و بیماری پوست را بهبود می بخشد، پشتیبانی کند."
یوکاریوت ها، باکتری ها و ویروس های جدید
مجموعه SMGC شامل 174 گونه باکتریایی ناشناخته، چهار یوکاریوت جدید و 20 فاژ جامبوی جدید - ویروس هایی با ژنوم بزرگتر از 200 کیلو باز، 3 تا 5 برابر بزرگتر از ویروس متوسط است. محققان قبلاً با دانش ناقصی از ترکیب باکتریایی میکروبیوم پوست کار کرده بودند. با این حال، این مطالعه کاتالوگ باکتری های شناخته شده پوست را تا 26 درصد افزایش می دهد.
علاوه بر باکتری‌ها و ویروس‌هایی که معمولاً در متاژنومیک از آنها بهبود می‌یابد، دوازده ژنوم از یوکاریوت‌های تک سلولی - قارچ‌ها، مانند مخمرها - را از پوست انسان پیدا کرده‌ایم. برخی از این ژنوم ها قبلاً شناخته شده بودند، مانند Malassezia globosa، که با مایکوبیوما پوست سالم مرتبط است، اما همچنین با شرایطی مانند شوره سر مرتبط است. راب فین، رهبر گروه در EMBL-EBI، گفت: استفاده از همان روش‌هایی که هشت ژنوم شناخته شده را بازیابی کرد، به ما اعتماد به چهار یوکاریوت جدیدی را که پیدا کردیم، می‌دهد.» بررسی مدل‌های این یوکاریوت‌های جدید نشان داد که یکی از آنها در بین داوطلبان بسیار رایج است. را می توان در بسیاری از ما یافت."
همه این داده‌ها به‌زودی پس از کاتالوگ ژنوم جدید در منبع داده MGnify، که در آن محققان می‌توانند مجموعه وسیعی از مجموعه داده‌های میکروبی، از جمله برای روده انسان، پیدا کنند، آزادانه در دسترس خواهند بود.
نقل قول: محققان باکتری ها و ویروس های جدیدی را روی پوست انسان شناسایی می کنند (2022، 4 ژانویه)، استخراج شده در 5 ژانویه 2022 از https://phys.org/news/2022-01-bacteria-viruses-human-skin.html
این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به جز هرگونه معامله منصفانه به منظور تحقیق یا مطالعه خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوا فقط برای مقاصد اطلاعاتی ارائه شده است.
[ad_2]