تلاش جهانی برای نقشهبرداری از ژنوم همه گیاهان، حیوانات، قارچها و سایر حیاتهای میکروبی روی زمین در حال ورود به مرحله جدیدی است که از پروژههای آزمایشی به توالییابی تولید در مقیاس کامل میرود. این مرحله جدید از The Earth BioGenome یا EBP با مجموعه ای از مقالات منتشر شده در این هفته در اطلاعیه های فرهنگستان های ملی علومتشریح اهداف پروژه، دستاوردهای تاکنون و مراحل بعدی.
هریس لوین، رئیس گروه کاری EBP و استاد محترم تکامل و بوم شناسی در دانشگاه کالیفرنیا، دیویس، گفت: "عملکرد ویژه EBP ماهیت و هیجان بزرگترین تلاش هماهنگ در تاریخ زیست شناسی را به تصویر می کشد." . از علوم پایه گرفته تا کاربردهای انقلابی در طیف گسترده ای از مسائل مهم جهانی، مانند جلوگیری از از دست دادن تنوع زیستی و تطبیق محصولات غذایی با تغییرات آب و هوایی، پیشرفت EBP در توالی زندگی یوکاریوتی آرامش بخش و الهام بخش است. اکنون به نظر می رسد دستیابی به هدف نهایی یعنی توالی یابی تمام حیات یوکاریوتی در دسترس ما باشد.
EBP که در نوامبر 2018 راه اندازی شد، با هدف ارائه کاتالوگ کاملی از توالی های DNA از تمام 1.8 میلیون گونه گیاهی، حیوانی و قارچی نامگذاری شده و همچنین یوکاریوت های تک سلولی است.
انتظار می رود زمین تا پایان این قرن 50 درصد از تنوع زیستی خود را بدون اقدامی برای محدود کردن تغییرات آب و هوایی و حفاظت از سلامت اکوسیستم های جهانی از دست بدهد. ایجاد یک کتابخانه دیجیتالی از توالی های DNA در طول زندگی یوکاریوتی شناخته شده می تواند به تولید ابزارهای موثر برای جلوگیری از از دست دادن تنوع زیستی و گسترش عوامل بیماری زا، نظارت و حفاظت از اکوسیستم ها و بهبود خدمات اکوسیستم کمک کند.
شبکه شبکه ها
این پروژه به عنوان یک شبکه بین المللی از شبکه ها عمل می کند که بسیاری از تلاش های گروهی، منطقه ای و ملی را هماهنگ می کند، مانند پروژه حفاظت از ژنوم کالیفرنیا (ایالات متحده آمریکا)، پروژه داروین در مورد درخت زندگی (بریتانیا و ایرلند)، پروژه ژنوم مهره داران و پروژه 10000 ژنوم پرنده
دفتر اداری پروژه در مرکز ژنوم UC Davis واقع شده است. این مرکز همچنین به عنوان یک مرکز اصلی تعیین توالی DNA برای پروژه حفاظت از ژنومیک کالیفرنیا، یک پروژه UC به رهبری پروفسور بردلی شفر از UCLA که هدف آن کمک به ایالت کالیفرنیا در مدیریت گونه های در معرض خطر و از نظر اقتصادی مهم با کمک ابزارهای ژنومی است، عمل می کند.
اهداف فاز 1
دو سال اول EBP، 2018-20، فاز اولیه بود. هدف برای فاز 1، تا سال 2023، تولید ژنوم مرجعی است که حدود 9400 خانواده طبقه بندی را نشان می دهد. تا به امروز، پروژههای مرتبط حدود 200 ژنوم مرجع را تولید کردهاند و انتظار میرود توالییابی، مونتاژ و حاشیهنویسی بیش از 3000 تا پایان سال 2022 تکمیل شود که حدود یک سوم هدف فاز 1 است.
از دسامبر 2021، این پروژه شامل 5000 دانشمند و کارمند فنی در 44 موسسه عضو در 22 کشور در هر قاره به جز قطب جنوب است. 49 پروژه مرتبط وجود دارد که بیشتر گروههای طبقهبندی یوکاریوتی را پوشش میدهد که به دهها هزار نمونه با کیفیت بالا از مجموعههای موزهها و زیستشناسان میدانی دسترسی دارند. اخیراً، گروهی از مؤسسات آفریقایی در 22 کشور به صورت آنلاین تحت عنوان پروژه BioGenome آفریقا ظاهر شدند. BIOSCAN، که فناوری بارکد DNA را برای شناسایی و شناسایی گونهها پیادهسازی میکند، و پروژه Global Virome، تلاشی برای شناسایی ویروسهای جدید که میتوانند تهدیدی همهگیر باشند، نیز به عنوان وابسته به آن ملحق شدهاند.
فعالیت های اصلی در طول سه سال اول شامل توسعه و ارزیابی استانداردها و استراتژی ها، سازماندهی پروژه های منطقه ای، ملی و فراملی، و ایجاد جوامع از طریق جلسات کمیته کاری منظم و کنفرانس سالانه است.
علاوه بر کمیته علمی بینالمللی که استانداردهایی را برای این پروژه تهیه میکند، EBP کمیتههایی را نیز در زمینه اخلاق، مسائل حقوقی و اجتماعی، و عدالت، انصاف، تنوع و شمول ایجاد کرده است. موضع فعال EBP در درک مسائل اخلاقی، قانونی و اجتماعی پیرامون پروژه، توصیه هایی را برای دسترسی و اشتراک منافع، برابری و ادغام جامعه در ژنومیک تنوع زیستی و جوامع محلی در بزرگترین کشورهای دارای تنوع زیستی جهان ارائه خواهد کرد.
نقل قول: پروژه Earth BioGenome توالی یابی ژنوم جدی را آغاز می کند (2022، 17 ژانویه)، بازیابی شده در 17 ژانویه 2022 از https://phys.org/news/2022-01-earth-biogenome-genome-sequencing-earnest. html
این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به جز هرگونه معامله منصفانه به منظور تحقیق یا مطالعه خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوا فقط برای مقاصد اطلاعاتی ارائه شده است.
[ad_2]
مقالات مشابه
- متس پیش نویس انتخاب اریک Orze است که دو بار سرطان بازمانده
- ارزانترین بازار جزیره قشم
- SpaceX با موفقیت راه اندازی آمریکا فضانوردان به فضا
- راهنمای خرید کفش ورزشی - ایران والیبال
- 'Carl Reiner بود نابغه کمدی': Jason Alexander می پردازد ادای احترام به اواخر کمدین, Rob Reiner واکنش نشان می دهد
- هدرز پراید یورو 4 فولادی - اگزوز خودرو مشهد
- Emmys 2020 snubs: نیکول کیدمن, 'Westworld,' Aaron Paul دست بالا نامزد
- بیش از 21,000 را امضا طومار برای حفظ دیزنی لند بسته میان coronavirus همه گیر
- Fauci می گوید واکسن 'احتمال' اما نه در زمان مدرسه: 5 takeaways از سنا coronavirus شنیدن
- جادوگران گارد Bradley Beal جزئیات تیره ارز با افسر پلیس در ترافیک متوقف